Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms