Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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