Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms