Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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