Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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