Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms