Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms