Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NUP35Q8NFH5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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