Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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