Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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