Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms