Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms