Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms