Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRB1P82279 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms