Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms