Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms