Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TGFBR1P36897 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms