Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ZNF738-203ENST00000594245 1086 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC009495.1-201ENST00000428888 372 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL031432.1-201ENST00000455902 988 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 INTS4-205ENST00000527522 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SAA3P-202ENST00000534768 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC007610.3-201ENST00000566879 934 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 FBXO9-203ENST00000370939 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms