Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF853P0CG23 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF853P0CG23 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms