Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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