Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms