Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms