Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms