Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FNDC8Q8TC99 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms