Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST2Q8NFU1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms