Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms