Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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