Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms