Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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