Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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