Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC19.71■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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