Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms