Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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