Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP13Q92995 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP13Q92995 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP13Q92995 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP13Q92995 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP13Q92995 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP13Q92995 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP13Q92995 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP13Q92995 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP13Q92995 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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