Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms