Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms