Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST2Q8NFU1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms