Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms