Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms