Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ETFRF1Q6IPR1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms