Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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