Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CELF4-203ENST00000420428 4052 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZSCAN31-201ENST00000344279 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SPATA3-AS1-201ENST00000414876 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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