Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms