Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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