Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms