Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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