Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCN2BO60939 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCN2BO60939 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCN2BO60939 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCN2BO60939 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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