Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms