Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms