Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C6orf48Q9UBA6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms